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Ficha CTI Vitae
HIRSH MARTINEZ LAYLA

Doctora en Biociencia y Biotecnología en la Universidad de Padua, Italia. Ingeniera Informática, con Maestría en Ciencias de la Computación. Profesora Asociada de la Pontificia Universidad Católica del Perú (PUCP) desde el 2008 en todos los cursos de nivel universitario. Colabora con el Instituto de Bioinformática Europeo (EMBL-EBI) y laboratorios de investigación de Argentina, Italia, Alemania, Francia y Serbia entre otros; Cuenta con publicaciones en revistas de alto impacto como Nucleic Acids Research(IF 11.5) y Bioinformatics(Q1) Concentró su investigación en estructuras repetitivas de proteínas y desarrolló un predictor para unidades repetidas que se usó para actualizar RepeatsDB, una base de datos de estructuras de proteína repetida

Fecha de última actualización: 12-04-2024
 
Código de Registro:   P0010452
Ver:   Ficha Renacyt


Scopus Author Identifier: 56639989000
Web of Science ResearcherID: null
Fecha:  22/11/2017

Datos Personales

    Fuente
Apellidos : HIRSH MARTINEZ
Nombres: LAYLA
Género: FEMENINO
Nacionalidad: PERÚ

Datos Actuales

Pagina web personal: http://www.pucp.edu.pe/profesor/layla-hirsh-martinez/
Pais de residencia: Perú

Experiencia Laboral

Institución Cargo Descripción del cargo Cargo en I+d+i Fecha Inicio Fecha Fin
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU DIRECTOR DE PROGRAMA Director de Programa de la especialidad de Ingeniería Informática Docente Investigador Abril 2019 Marzo 2022
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ DIRECTORA DE ESTUDIOS Directora de Estudios de la Unidad Académica de Estudios Generales Ciencias Otros cargos relacionados a (I+D+i) Marzo 2022 A la actualidad
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ COORDINADORA DE LA OFICINA DE BIENESTAR CIENCIAS Coordinador de la oficina de Bienestar de la unidad de Estudios Generales Ciencias de la universidad Otros cargos relacionados a (I+D+i) Marzo 2021 A la actualidad
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ INVESTIGADOR DE ALTO RENDIMIENTO Investigador reconocido por el alto impacto de sus publicaciones Docente Investigador Marzo 2021 A la actualidad
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU COORDINADORA DE BIENESTAR CIENCIAS Coordinadora de la Oficina de Bienestar de Estudios Generales Ciencias Otros cargos relacionados a (I+D+i) Marzo 2021 Abril 2023

Experiencia Laboral como Docente

Institución Tipo Institución Tipo Docente Descripción del cargo Fecha Inicio Fecha Fin
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Universidad Ordinario-Principal Marzo 2006 A la actualidad

Experiencia como Asesor de Tesis

Universidad Tesis Tesista(s) Repositorio Fecha Aceptación de Tesis
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Licenciado / Título Ever Ricardo Mitta Flores Diciembre 2012
INSTITUTO SUPERIOR TECNICO UNIVERSIDADE DE LISBOA Magister Miguel Pacheco de Melo Flores Ribeiro Junio 2019
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ Licenciado / Título TENORIO KU, LUIGGI GIANPIERE. Enero 2021
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ Licenciado / Título Manuel Alberto Bezerra Brandao Corrales Agosto 2021
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ Magister Luis Fernando Muroya Tokushiro Octubre 2021
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Licenciado / Título Solange Estrella Palomino Chahua Febrero 2023
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Licenciado / Título Johana Beatriz Diaz Ponte Mayo 2023
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Magister Manuel Bezerra Brandao Corrales Julio 2023

Experiencia como evaluador y/o formulador de proyectos

Tipo de experiencia Ańo Tipo de proyecto Entidad financiadora Nombre del concurso Metodología de evaluación Monto proyecto (USD)
Experiencia como formulador(sólo proyectos ganados) 2019 Proyectos de investigación básica UNIÓN EUROPEA: PROGRAMA DE INVESTIGACIÓN E INNOVACIÓN HORIZONTE 2020 MCSA RISE Action 2483716.0
Experiencia como formulador(sólo proyectos ganados) 2020 Proyectos de investigación aplicada FONDECYT - PERÚ Proyectos Especiales: Respuesta al COVID-19 - Fondecyt 45000.0
Experiencia como formulador(sólo proyectos ganados) 2021 Proyectos de equipamiento cientifico/tecnológico FONDO NACIONAL DE DESARROLLO CIENTIFICO, TECNOLOGICO Y DE INNOVACION TECNOLOGICA - FONDECYT PROYECTOS ESPECIALES: MODALIDAD - Escalamiento de kits de diagnóstico, dispositivos y tecnologías médicas para el COVID- 19 424440.0

Formación Académica (Fuente: SUNEDU)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fuente
MAGISTER MAGISTER EN CIENCIAS DE LA COMPUTACION PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ PERÚ
LICENCIADO / TÍTULO INGENIERO INFORMATICO PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ PERÚ
BACHILLER BACHILLER EN CIENCIAS PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ PERÚ
DOCTORADO DOCTORADO EN BIOCIENCIAS Y BIOTECNOLOGÍAS - CURRÍCULUM DE BIOQUÍMICA Y BIOFÍSICA UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI PADOVA ITALIA

Formación Académica (Fuente: Manual)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fecha de inicio Fecha fin Fuente

Estudios Técnicos

Centro de estudios Carrera Fecha de Inicio Fecha de fin

Estudios académicos y/o técnicos superiores en curso

Centro de estudios Carrera Tipo de estudios Fecha de inicio

Formación Complementaria

Centro de estudios Capacitación complementaria Frecuencia Cantidad País de estudio Fecha de inicio Fecha fin
EBI-EMBL EUROPEAN BIOINFORMATICS INSTITUTE ANOTACION DE PROTEINAS - BASE DE DATOS PFAM - SEQUENCE FAMILY GROUP MESES 3 Inglaterra Enero 2019 Abril 2019

Idiomas

Idioma Lectura Conversación Escritura Forma de aprendizaje Lengua Materna
FRANCES BÁSICO BÁSICO BÁSICO Estudio Instituto NO
ITALIANO AVANZADO INTERMEDIO INTERMEDIO Estudio Instituto NO
INGLES AVANZADO AVANZADO AVANZADO Estudio Instituto NO
ESPAÑOL O CASTELLANO AVANZADO SUPERIOR AVANZADO SUPERIOR AVANZADO SUPERIOR Otros SI

Línea de investigación

Área Sub área Disciplina Temática Ambiental Temática Médica y de la Salud
Ingeniería y Tecnología Otras Ingenierías y Tecnologías Otras ingenierías y tecnologías
Ciencias Naturales Computación y ciencias de la información Ciencias de la información y bioinformática

Producción científica

Tipo Producción Título Autor Año de Producción DOI Revista Fuente Cuartil de ScimagoJR o JCR*
Artículo en revista científica A STRP-ed definition of Structured Tandem Repeats in Proteins Monzon A.M. 2023 10.1016/J.JSB.2023.108023 Journal of Structural Biology 2023: No disponible**, 2020: Q1
Artículo en revista científica Daisy: An integrated repeat protein curation service Bezerra-Brandao M. 2023 10.1016/J.JSB.2023.108033 Journal of Structural Biology 2023: No disponible**, 2020: Q1
Artículo en revista científica CoDNaS-RNA: A database of conformational diversity in the native state of RNA González Buitrón M. 2022 10.1093/bioinformatics/btab858 Bioinformatics Q1
Artículo en revista científica CoDNaS-Q: a database of conformational diversity of the native state of proteins with quaternary structure Escobedo N. 2022 10.1093/BIOINFORMATICS/BTAC627 Bioinformatics (Oxford, England) 2022: No disponible**, 2020: Q1
Artículo en revista científica RepeatsDB in 2021: Improved data and extended classification for protein tandem repeat structures Paladin L. 2021 10.1093/nar/gkaa1097 Nucleic Acids Research Q1
Artículo en revista científica Revenant: A database of resurrected proteins Carletti M.S. 2020 10.1093/database/baaa031 Database : the journal of biological databases and curation Q1
Artículo en revista científica The Pfam protein families database in 2019 El-Gebali S. 2019 10.1093/NAR/GKY995 Nucleic Acids Research Q1
Artículo en revista científica Classification of β-hairpin repeat proteins Roche D.B. 2018 10.1016/j.jsb.2017.10.001 Journal of Structural Biology Q1
Artículo en revista científica RepeatsDB-lite: A web server for unit annotation of tandem repeat proteins Hirsh L. 2018 10.1093/nar/gky360 Nucleic Acids Research Q1
Artículo en revista científica RepeatsDB 2.0: Improved annotation, classification, search and visualization of repeat protein structures Paladin L. 2017 10.1093/nar/gkw1136 Nucleic Acids Research Q1
Erratum Erratum: RepeatsDB 2.0: improved annotation, classification, search and visualization of repeat protein structures (Nucleic acids research (2017) 45 D1 (D308-D312)) Paladin L. 2017 10.1093/nar/gkw1268 Nucleic Acids Research No Aplica
Artículo en revista científica Identification of repetitive units in protein structures with ReUPred Hirsh L. 2016 10.1007/s00726-016-2187-2 Amino Acids Q1
Artículo en revista científica The Victor C++ library for protein representation and advanced manipulation Hirsh L. 2015 10.1093/BIOINFORMATICS/BTU773 Bioinformatics Q1
Book Resolución de problemas usando Visual Basic for Applications en Excel Hirsh Martínez, Layla 2012 No Aplica
Conference Paper Basic considerations for the management of medical records in Peru Hirsh L. 2010 10.1109/PAHCE.2010.5474591 Pan American Health Care Exchanges, PAHCE 2010 No Aplica
BachelorThesis Intérprete y entorno de desarrollo para el aprendizaje de lenguajes de programación estructurada Hirsh Martínez, Layla 2007 No Aplica

* Sólo se presentan los cuartiles para la producción tipo artículos y review.

** Cuartil no disponible para el año de la publicación.

*** La revista no tiene cuartil en el año de la publicación.


Otras Producciones

Tipo de Producción Título Año de Producción Título de la fuente
ARTÍCULO EN CONGRESO How To Teach Programming Language. 2013
ARTÍCULO EN CONGRESO Interprete y Entorno de desarrollo para el aprendizaje de lenguajes de programacion estructurada 2008
RESUMEN DE CONGRESO Evolution of repeat proteins by exon duplication 2017
CARTEL DE CONFERENCIA/POSTER Conformational ensembles inside alpha-solenoids proteins 2017
CARTEL DE CONFERENCIA/POSTER Unit annotation of tandem repeat proteins, RepeatsDB-Lite. 2018
RESUMEN DE CONGRESO Propuestas de solución a algunos problemas de modelado de proteínas repetidas 2018
RESUMEN DE CONGRESO RepeatsDB 2.0: improved annotation, classification, search and visualization of repeat protein structures 2018
RESUMEN DE CONGRESO Repeats prediction from structure 2018
RESUMEN DE CONGRESO Resources for repeat protein structure annotation: RepeatsDB and RepeatsDB-lite 2018
RESUMEN DE CONGRESO Automatic annotation of HMM for repeat proteins 2020
OTROS Científicas peruanas que luchan contra la covid-19. 2020
RESUMEN DE CONGRESO Structural bioinformatics- Repeat proteins 2020

Proyectos de Investigación

Tipo Proyecto Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha Fin Inv. Principal Área OCDE
Proyectos de investigación PRECIOSA, Erasmus mundus Action 2, Lot 12 a novel method for the fast automatic prediction of repeat units and repeat classification using an extensive Structure Repeat Unit Library (SRUL) derived from RepeatsDB UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI PADOVA Enero 2014 Noviembre 2017 LAYLA HIRSH MARTINEZ
Proyectos de investigación Development of computational resources to support biological data curation Ministerio de Salud italiana con el departamento de ciencias biomedicas de la universidad de padua UNIVERSIDAD DE PADUA Abril 2017 Diciembre 2017 SILVIO TOSATTO Ciencias Naturales
Proyectos de investigación Repeat protein Function Refinement, Annotation and Classification of Topologies The REFRACT proposal answers the RISE call, aiming at the promotion of an international and interdisciplinary collaboration on tandem repeat proteins (TRPs) through the sharing of knowledge and expertise between partners via staff exchanges. REFRACT is an international consortium aiming to extend our knowledge on the mechanism of TRP function and evolution, establishing a common classification and best practices. UNIVERSITÀ DEGLI STUDI DI PADOVA Enero 2019 Enero 2022 SILVIO TOSATTO (COORDINACIÓN DEL PROYECTO) Ciencias Naturales
Proyectos de investigación “Caracterizando al COVID- 19: Herramienta de análisis de datos de pacientes del COVID-19”, El principal objetivo del presente proyecto es desarrollar un App capaz de recolectar información sobre el COVID-10 la cual será utilizada para la búsqueda de un tratamiento efectivo, como para definir medidas de mitigación para evitar rebrotes. El App sería utilizado para seguir a los pacientes enfermos durante el desarrollo de la enfermedad, y posteriormente a su alta (Figura 2). PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ Julio 2020 Febrero 2021 LAYLA HIRSH MARTINEZ Ciencias Médicas y de la Salud
Proyectos de investigación ARIM 2.0: Aplicación para el registro de información médica para apoyar el sector salud durante la pandemia COVID-19 en Perú La propuesta es el escalamiento, la implantación y puesta en producción de una versión mejorada de la aplicación móvil ARIM en el Hospital de Emergencia José Casimiro Ulloa(HEJCU) y el Hospital Cayetano Heredia(HCH), esta aplicación movil fue parte de la tecnología desarrollada durante el proyecto denominado: Caracterización de COVID-19: Herramienta de análisis de datos de pacientes COVID-19 – el cual fue financiado en el marco de los Proyectos Especiales: Respuesta al COVID-19 (convocatoria 202 PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ Julio 2021 Diciembre 2021 LAYLA HIRSH MARTINEZ Ingeniería y Tecnología

Proyectos importados de ORCID

Tipo de financiamiento Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha de Fin

Derechos de Propiedad Intelectual

Título de la Propiedad Intelectual (PI) Tipo de PI Entidad donde se tramitó la PI País Nombre del propietario de la PI Trámite vía PCT Estado de la patente Número de registrode la PI Rol de participación Participación en los derechos de la PI

Productos de Desarrollo Industrial

Denominación Tipo de desarrollo Tipo de participación Estado del desarrollo Alcance del desarrollo Estado del uso del desarrollo Propietario del desarrollo

Distinciones y Premios

Institución Distinción Descripción País Web Referencia
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Premio Galileo 2009 Premio otorgado por la escuela de posgrado PERÚ http://posgrado.pucp.edu.pe/beca-fondo/fondo-galileo/
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU reconocimiento a la investigación 2017 Premio a las publicaciones realizadas PERÚ http://cdn02.pucp.education/investigacion/2018/05/15150323/OPEI-Lista-final-de-ganadores-RI-2017.pdf
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU reconocimiento a la investigación 2016 Premio a las publicaciones cientificas realizadas PERÚ http://cdn02.pucp.education/investigacion/2017/02/14221800/OPEI-Lista-final-de-ganadores-RI-2016.pdf
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU reconocimiento a la investigación 2015 Reconocimiento por la investigación realizada PERÚ
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATÓLICA DEL PERÚ Reconocimiento a la investigación 2019 PREMIO A LAS PUBLICACIONES CIENTIFICAS REALIZADAS PERÚ
UNESCO-LOREAL Premio Por las mujeres en la Ciencia 2021 Categoría - Talentos en ascenso PERÚ
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Premio a la investigación 2022 PREMIO A LAS PUBLICACIONES CIENTIFICAS REALIZADAS PERÚ
PONTIFICIA UNIVERSIDAD CATOLICA DEL PERU Premio a la investigación 2020 PREMIO A LAS PUBLICACIONES CIENTIFICAS REALIZADAS PERÚ
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