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Ficha CTI Vitae
MACHACA ARCEDA VICENTE ENRIQUE

Passionate about artificial intelligence applied to bioinformatics, I have worked on projects related to image processing and machine learning. Currently, I am involved in detecting cancer neoantigens using Transformers and Transfer Learning, aiming to support the development of personalized vaccines.

Fecha de última actualización: 14-03-2024
 
Código de Registro:   P0022551
Ver:   Ficha Renacyt


Scopus Author Identifier: 58554288300
Fecha:  06/07/2017

Datos Personales

    Fuente
Apellidos : MACHACA ARCEDA
Nombres: VICENTE ENRIQUE
Género: MASCULINO
Nacionalidad: PERÚ

Datos Actuales

Pagina web personal: http://www.linkedin.com/profile/view?id=171618362&trk=nav_responsive_tab_profile
Pais de residencia: Perú

Experiencia Laboral

Institución Cargo Descripción del cargo Cargo en I+d+i Fecha Inicio Fecha Fin
UNIVERSIDAD DE LA SALLE DOCENTE INVESTIGADOR Docente investigador Otros cargos relacionados a (I+D+i) Setiembre 2017 A la actualidad
UTEC DOCENTE Otros cargos relacionados a (I+D+i) Agosto 2021 A la actualidad
UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN DOCENTE Docente Docente Investigador Agosto 2017 A la actualidad
TATA CONSULTANCY SERVICES - TCS SYSTEM ENGINEER Desarrollo y analisis de sistemas, elaboración de reportes gerenciales.. Abril 2013 Mayo 2014
CORIING EIRL ANALISTA PROGRAMADOR Funciones: - Se desempeño el cargo de analista y jefe de equipo de desarrollo. - Desarrollo de sistemas para municipalidades como: Sistema de tramite documentario. Julio 2011 Marzo 2013
CTD V&C SAC ANALISTA PROGRAMADOR Funciones: - Análisis de requerimientos. - Diseño de la base de datos. - Implementación de los sistemas. - Configuración de servidores Linux. Octubre 2010 Junio 2011
REGESA SCRL ANALISTA PROGRAMADOR Funciones: - Análisis de requerimientos. - Diseño de la base de datos. - Implementación de los sistemas tributarios. Octubre 2009 Setiembre 2010

Experiencia Laboral como Docente

Institución Tipo Institución Tipo Docente Descripción del cargo Fecha Inicio Fecha Fin
UTEC Universidad Contratado Docente Agosto 2021 A la actualidad
UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN Universidad Contratado Docente contrato en la escuela profesional de Ingeniería de Sistemas Setiembre 2017 A la actualidad
UNIVERSIDAD DE LA SALLE Universidad Contratado Docente e investigador Julio 2017 A la actualidad

Experiencia como Asesor de Tesis

Universidad Tesis Tesista(s) Repositorio Fecha Aceptación de Tesis
UNIVERSIDAD TECNOLOGICA DEL PERU S.A.C. O UTP S.A.C. Licenciado / Título Barreto Rodriguez, Robert Marcos Julio 2019
UNIVERSIDAD TECNOLOGICA DEL PERU S.A.C. O UTP S.A.C. Licenciado / Título Jewison Cruz, Ronny Diaz Agosto 2019
UNIVERSIDAD DE LA SALLE Licenciado / Título JASON PAUL CAHUANA NINA Noviembre 2021
UNIVERSIDAD TECNOLOGICA DEL PERU S.A.C. O UTP S.A.C. Licenciado / Título Chirinos Moscoso, Kathya Yesabella Jacinto Kana, David Samuel Abril 2020
UNIVERSIDAD LA SALLE Licenciado / Título Walker Fernando Manrique Chalco Mayo 2023

Experiencia como evaluador y/o formulador de proyectos

Tipo de experiencia Ańo Tipo de proyecto Entidad financiadora Nombre del concurso Metodología de evaluación Monto proyecto (USD)
Experiencia como Evaluador 2016 Otros Articulo de congreso LACCEI Evaluador único/individual 0.0

Formación Académica (Fuente: SUNEDU)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fuente
BACHILLER BACHILLER EN INGENIERIA DE SISTEMAS UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTÍN PERÚ
LICENCIADO / TÍTULO INGENIERO DE SISTEMAS UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN PERÚ
MAGISTER MAESTRO EN CIENCIAS: INFORMATICA, ESPECIALIDAD: MENCION EN TECNOLOGIAS DE INFORMACION UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN PERÚ

Formación Académica (Fuente: Manual)

Grado Título Centro de Estudios País de Estudios Fecha de inicio Fecha fin Fuente
DOCTORADO DOCTORADO EN CIENCIAS DE LA COMPUTACIÓN UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTÍN DE AREQUIPA PERÚ Octubre 2019 Diciembre 2023

Estudios Técnicos

Centro de estudios Carrera Fecha de Inicio Fecha de fin

Estudios académicos y/o técnicos superiores en curso

Centro de estudios Carrera Tipo de estudios Fecha de inicio

Formación Complementaria

Centro de estudios Capacitación complementaria Frecuencia Cantidad País de estudio Fecha de inicio Fecha fin

Idiomas

Idioma Lectura Conversación Escritura Forma de aprendizaje Lengua Materna
FRANCES BÁSICO BÁSICO BÁSICO Estudio Instituto NO
INGLES AVANZADO AVANZADO AVANZADO Estudio Instituto NO
ESPAÑOL O CASTELLANO AVANZADO AVANZADO AVANZADO Autodidacta SI

Línea de investigación

Área Sub área Disciplina Temática Ambiental Temática Médica y de la Salud
Ciencias Naturales Computación y ciencias de la información Ciencias de la computación
Ingeniería y Tecnología Ingenierías Eléctrica, Electrónica e Informática Ingeniería de sistemas y comunicaciones

Producción científica

Tipo Producción Título Autor Año de Producción DOI Revista Fuente Cuartil de ScimagoJR o JCR*
Journal - Article Transformers meets neoantigen detection: a systematic literature review Machaca, Vicente | Goyzueta, Valeria | Cruz, Maria Graciel | Sejje, Erika | Pilco, Luz Marina | Lopez, Julio | Tupac, Yvan 2024 10.1515/JIB-2023-0043 JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOINFORMATICS S/C***
Conference Paper DNA Genome Classification with Machine Learning and Image Descriptors Cussi D.P. 2023 10.1007/978-3-031-28073-3_4 Lecture Notes in Networks and Systems No Aplica
Conference Paper Neoantigen Detection Using Transformers and Transfer Learning in the Cancer Immunology Context Arceda V.E.M. 2023 10.1007/978-3-031-38079-2_10 Lecture Notes in Networks and Systems No Aplica
Conference Paper Deep Learning and Transformers in MHC-Peptide Binding and Presentation Towards Personalized Vaccines in Cancer Immunology: A Brief Review Machaca V.E. 2023 10.1007/978-3-031-38079-2_2 Lecture Notes in Networks and Systems No Aplica
Conference Paper ArgosMol: A Web Tool for Protein Structure Prediction and Visualization Condori E.S. 2022 10.1007/978-3-030-98012-2_43 Lecture Notes in Networks and Systems No Aplica
Conference Paper Forecasting Time Series with Multiplicative Trend Exponential Smoothing and LSTM: COVID-19 Case Study Arceda M.A.M. 2021 10.1007/978-3-030-63089-8_36 Advances in Intelligent Systems and Computing No Aplica
Conference Paper An Analysis of k-Mer Frequency Features with Machine Learning Models for Viral Subtyping of Polyomavirus and HIV-1 Genomes Arceda V.E.M. 2021 10.1007/978-3-030-63128-4_21 Advances in Intelligent Systems and Computing No Aplica
Conference Paper Small Ship Detection on Optical Satellite Imagery with YOLO and YOLT Nina W. 2020 10.1007/978-3-030-39442-4_49 Advances in Intelligent Systems and Computing (discontinued) No Aplica
Book in series - Proceedings Paper Small Ship Detection on Optical Satellite Imagery with YOLO and YOLT Nina, Wilder | Condori, William | Machaca, Vicente | Villegas, Juan | Castro, Eveling 2020 10.1007/978-3-030-39442-4_49 S/C***
Journal - Article An analysis of k-mer frequency features with SVM and CNN for viral subtyping classification Machaca Arceda, Vicente Enrique 2020 10.24215/16666038.20.E11 Journal of Computer Science & Technology S/C***
Conference Paper A survey on drowsiness detection techniques<sup>?</sup> Machaca Arceda V.E. 2020 CEUR Workshop Proceedings No Aplica
Conference Paper Fast car crash detection in video Machaca Arceda V.E. 2018 10.1109/CLEI.2018.00081
Artículo en revista científica Fast Face Detection in Violent Video Scenes Machaca Arceda V.E. 2016 10.1016/j.entcs.2016.12.002 Electronic Notes in Theoretical Computer Science Q2
Conference Paper Real time violence detection in video Arceda V.M. 2016 IET Seminar Digest No Aplica

* Sólo se presentan los cuartiles para la producción tipo artículos y review.

** Cuartil no disponible para el año de la publicación.

*** La revista no tiene cuartil en el año de la publicación.


Otras Producciones

Tipo de Producción Título Año de Producción Título de la fuente
ARTÍCULO EN CONGRESO Real Time Violence Detection in Video with ViF and Horn-Schunk 2016
ARTÍCULO EN CONGRESO Optimization model for face detection in video sequences 2016
CARTEL DE CONFERENCIA/POSTER Detección de acciones violentas en tiempo real con ViF y Horn-Schunck 2015
CARTEL DE CONFERENCIA/POSTER MODELO PARA LA DETECCIÓN DE ROSTROS EN SECUENCIAS DE VIDEO 2015
ARTÍCULO EN REVISTA CIENTÍFICA Fast Face Detection in Violent Video Scenes 2016 Electronic Notes in Theoretical Computer Science
ARTÍCULO EN REVISTA CIENTÍFICA An analysis of k-mer frequency features with SVM and CNN for viral subtyping classification 2020 Journal of Computer Science and Technology
ARTÍCULO EN CONGRESO ArgosMol: A Web Tool for Protein Structure Prediction and Visualization 2022
LIBRO Fighting the COVID-19 Pandemic 2021

Proyectos de Investigación

Tipo Proyecto Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha Fin Inv. Principal Área OCDE
Proyectos de investigación Ciencia Aplicada: Detección de rastreo y Reconocimiento de Rostros en Escenas de video - Proyecto de los Círculos de Investigación en Realidad Aumentada para fines de Tránsito de Vehículos y Seguridad Ciudadana Creación de técnicas de análisis de imágenes, visión computacional, computación de alto desempeño (CPU-Multi-Threading y GPU-Massive-Threading), visualización científica y realidad aumentada, para ofrecer a la comunidad herramientas tecnológicas para atacar el problema de la seguridad ciudadana UNIVERSIDAD CATOLICA SAN PABLO Diciembre 2014 Diciembre 2017 ALEX JESÚS CUADROS VARGAS Ciencias Naturales
Proyectos de investigación Detección de acciones violentas en escenas de vídeo con fines de seguridad ciudadana Sistema de videovigilancia que plantea la detección de diferentes acciones violentas las cuales seran alertadas en tiempo real a la policia y entidades correspondientes. UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN Enero 2017 Enero 2019 JUAN CARLOS GUTIERREZ CACERES Ingeniería y Tecnología
Proyectos de investigación ARGOS Argos es un dispositivo que al instalarlo en paneles digitales de publicidad, este realiza un analisis del flujo de personas. A fin de mes ARGOS muestra reportes detallados de la cantidad de personas que vieron el anuncio, cantidad de hombres, mujeres y sus rangos de edad. FINANCIADO POR STARTUP PERU ARGOS DIGITAL SOCIEDAD ANONIMA CERRADA - ARGOS DIGITAL S.A.C. Julio 2016 Marzo 2018 VICENTE ENRIQUE MACHACA ARCEDA Ingeniería y Tecnología
Proyectos de investigación Desarrollo de un sistema adaptativo para la detección de somnolencia en conductores de transporte interprovincial idóneo para las características únicas de las carreteras del Perú mediante sensado híbrido utilizando técnicas de deep learning El proyecto se basa en desarrollar un dispositivo que acopla una cámara y sensores de presión atmosférica, ángulos de giros del timón, altura, etc. para la detección de somnolencia. X-TRA PLUS SOLUCIONES DE ENERGIA S.A.C. Agosto 2019 Marzo 2021 MEDARDO DELGADO PAREDES Ingeniería y Tecnología
Proyectos de investigación ADAPTACIÓN DE ESTIMADORES DE BIOMASA NO INSTRUSIVA CON CÁMARAS STEREO Y FRAME PARA CRIANZA DE PECES UTILIZANDO MODELOS DEEP LEARNING Y SECUENCIA DE VIDEOS. CASO DE ESTUDIO CULTIVO DE TRUCHA ARCOIRIS EN JAULA FLOTANTE UBICADO EN LA LOCALIDAD DE POMATA - PUNO. La propuesta de valor se enfoca en la adaptación de una nueva tecnología mediante un prototipo validado a escala piloto de un sistema integrado con IA capaz de estimar automáticamente y con una alta precisión la biomasa de las truchas mediante el procesamiento de la información obtenida por la detección. Los productores al obtener datos más confiables, rápidos y sin manipulación directa de los peces podrán determinar la evolución del factor de condición de la biomasa y/o tomar decisiones VEOX S.A.C. Abril 2022 Enero 2023 VICENTE ENRIQUE MACHACA ARCEDA Ingeniería y Tecnología
Proyectos de investigación Principales estrategias y métodos basados en deep learning para la detección de neoantígenos en el marco del desarrollo de vacunas personalizadas en la inmunoterapia del cáncer En este contexto, en este proyecto se plantea realizar una revisión sistemática de la literatura sobre los métodos utilizados en la detección de neoantígenos que se basen en el uso de técnicas de deep learning. UNIVERSIDAD LA SALLE Marzo 2022 Octubre 2022 VICENTE ENRIQUE MACHACA ARCEDA Ingeniería y Tecnología
Proyectos de investigación Desarrollo de una Aplicación Web para la Detección de Neoantígenos en el Marco de Desarrollo de Vacunas Personalizadas para Tratar el Cáncer Este proyecto determina la detección de neoantígenos enfocados en la predicción del enlace entre péptidos y la proteína Major Histocompatibility Complex (pMHC). Esta es una de las fases de mayor importancia dentro del proceso de detección de neoantígenos. Para la predicción del enlace pMHC, se utilizó fine-tuning de modelos Transformers: TAPE, ProtBert y ESM2. Como resultado, obtuvimos un modelo que supera en accuracy, AUC, recall y F1-score a NetMHCpan4.1 y MHCflurry. UNIVERSIDAD LA SALLE Agosto 2023 Enero 2024 VICENTE ENRIQUE MACHACA ARCEDA Ingeniería y Tecnología
Proyectos de investigación NeoArgos-tools: Un Pipeline de Detección In-silico de Neoantígenos de Cáncer para el Desarrollo de Vacunas Personalizadas Un pipeline para la detección de neoantígenos involucra la integración de varias herramientas desde el alineamiento de secuencias, llamado de variantes, anotación de variantes y predicción del enlace pMHC. Es así, que se plantea el desarrollo del pipeline NeoArgosTools v1.0, esta herramienta toma como entrada archivos VCF, luego utiliza las herramientas de anotación de variantes Isovar y Annovar. Finalmente se integra al pipeline, un modelo basado en Transformers para predecir el enlace pMHC. UNIVERSIDAD LA SALLE Noviembre 2023 Junio 2024 VICENTE ENRIQUE MACHACA ARCEDA Ingeniería y Tecnología

Proyectos importados de ORCID

Tipo de financiamiento Título Descripción Institución Fecha de Inicio Fecha de Fin

Derechos de Propiedad Intelectual

Título de la Propiedad Intelectual (PI) Tipo de PI Entidad donde se tramitó la PI País Nombre del propietario de la PI Trámite vía PCT Estado de la patente Número de registrode la PI Rol de participación Participación en los derechos de la PI
Sistema de reconocimiento automático de eventos delictivos en interiores y gestión de alarmas Patente de invención INDECOPI PERÚ Vicente Machaca Arceda No En trámite 17262020 Parte del equipo de (I+D) Si

Productos de Desarrollo Industrial

Denominación Tipo de desarrollo Tipo de participación Estado del desarrollo Alcance del desarrollo Estado del uso del desarrollo Propietario del desarrollo
Argos Producto Coordinador/gestor Terminado Nuevo Uso interno en la entidad Vicente Machaca Arceda

Distinciones y Premios

Institución Distinción Descripción País Web Referencia
UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN Alumno excelencia Distinción por haber obtenido uno de los promedios mas altos ademas de llevar una mayor cantidad de cursos en la "Maestría en Informatica" convenio UNSA-CONCYTEC PERÚ
UNIVERSIDAD NACIONAL DE SAN AGUSTIN Acreedor a una beca para estudiar una maestría en ciencias informática Acreedor a una beca para estudiar una maestría en ciencias informática, del programa de maestría en convenio UNSA-CONCYTEC. Dicha maestría fue a tiempo completo. PERÚ
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